跨膜區預測

跨膜區即蛋白質序列中跨越細胞膜的區域,通常為α-螺旋結構,約20~25個氨基酸殘基,構成跨膜區蛋白的氨基酸大部分是疏水性氨基酸。

對序列進行跨膜區預測是十分必要的。通常,膜蛋白不能在原核表達系統中表達,如果對序列進行跨膜區預測發現序列中存在跨膜區,則在后續需要選擇真核表達系統進行表達;如果想利用原核表達系統進行表達,需要對跨膜區序列進行敲除。

使用方法

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結果分析

跨膜區預測結果中有三個值:Inside、Outside、Transmembrane。

Inside表示胞內區,inside數值越大,表示該氨基酸位于胞內區的可能性越大;

Outside表示胞外區,outside數值越大,表示該氨基酸位于胞外區的可能性越大。

Transmembrane表示跨膜區,Transmembrane數值越大,表示該氨基酸在跨膜區的可能性越大;

其它常用序列分析工具:信號肽分析疏水性分析工具基因重復序列計算器

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