信號肽分析

信號肽通常位于氨基酸序列的N端,是引導新合成的蛋白質向分泌通路轉移的短肽鏈,一般長度為5~30個氨基酸。信號肽的主要作用是促進蛋白分泌到胞外。在進行重組蛋白表達前,需要對序列進行信號肽預測,如果預測結果為序列中沒有信號肽,則需要在后續載體構建過程中加上一段信號肽,以增加分泌蛋白的表達量。

使用方法

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結果分析

信號肽分析結果中,包含三個值:S-score、C-score和Y-score。

S-score:每個氨基酸對應1個S值,在結果顯示的圖標中有一個曲線顯示S值的變化趨勢,信號肽區域的S值較高

C-score:剪切位點的值。每個氨基酸會有一個C值,在剪切位點處的C值是最高的。

Y-score:Y值是綜合考慮S值和C值的一個參數,其比單獨考慮C值要精準,因為在一系列中C值可能有不止一個較高的位點,但是剪切位點只有一個;此時的剪切位點就由Y-max值來推測,S值是陡峭的位值和具有高C值的位點即為剪切點

其它常用序列分析工具:跨膜區預測疏水性分析工具抗原決定簇預測(v1)

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