稀有密碼子分析工具

稀有密碼子:遺傳密碼子有64種,但是絕大多數生物使用密碼子具有偏好性,傾向于利用這些密碼子中的一部分。被最頻繁利用的稱為佳密碼子,那些不被經常利用的稱為稀有密碼子。

稀有密碼子的使用頻率是影響重組表達水平的一個重要因素,利用稀有密碼子計算工具可以計算出目標序列的密碼子使用頻率,并且顯示密碼子使用頻率的分布情況。根據分析結果對序列進行優化,可以有效提高重組蛋白的表達水平。在進行重組蛋白表達前,了解序列中稀有密碼子的使用頻率、分布情況并對序列進行優化是十分重要的。

使用方法

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結果分析

分析結果以圖表形式展現,結果中密碼子得分越高,表示序列中該密碼子使用頻率越高;得分越低表示該密碼子的使用頻率越低。該稀有密碼子分析工具同時也會對序列在宿主細胞的密碼子適應指數進行分析,并將結果展示在圖表下方。

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