密碼子適應指數(CAI)分析

密碼子適應指數(CAI)是指編碼區同義密碼子與最佳密碼子使用頻率的相符程度,取值在0~1之間。CAI可以用來評估外源基因在宿主內的表達水平,CAI越高,則外源基因在宿主內的表達水平越高。

密碼子適應指數分析工具的工作原理為:以高表達基因的序列為參考(參考序列),評估目的基因與參考序列的密碼子使用頻率相符程度。

如果分析得到的CAI很低,則基因在宿主細胞內的表達水平低,需要對目標序列進行密碼子優化

使用方法

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